Web2.0 是一件偉大的新工具還是一場華麗的冒險
发表于 2008-05-09 20:17
“科學的發展,不僅在於研究人員進行這些實驗,更在於他們討論這些實驗。”公共科學圖書館(PLoS ONE)之線上網路期刊的總編輯Christopher Surridge這樣解釋道。批評、建議、交流思想與資料共用——溝通是科學研究的核心,是世界上最強大的工具,可以用來糾正錯誤、組織工作與創造新知。不只在同行評議(peer-reviewed)論文時需要溝通,而這種溝通與論文本身同等重要,發表過大量論文的Surridge認為,“這種溝通能有效地及時獲知作者為文的意圖與當前的見解。除此之外,論文並不是協作完成的,除了一些基本的部分,譬如引言與致編者等。”
Bill Hooker認為,Web 2.0的技術實現了一種更為豐富的對話。Bill Hooker是俄勒岡州波特蘭Shriners兒童醫院的一名博士後的癌症研究員,也是三誇克日報(3 Quarks Daily)有關開放式科學調研(分為三部分)的博客撰文小組的作者之一。“對我而言,公開我的實驗室記錄,意味著給予他人通向自己每天所做之事的一扇視窗,從中可以清楚地看到各個巨大飛躍形成的動態過程。在論文中,我只能看到你完成了哪些成功的實驗,但不知道你經歷過多少次失敗的嘗試。這些小細節,正是通過開放的實驗室記錄才變得更為清晰,但在其他的溝通機制下卻往往會被掩蓋。這種開放實驗室記錄的做法,使得科研變得更為高效。”在科研效率方面的飛躍,進而可為社會發揮巨大效用,無論是藥物開發速度的日益加快,還是綜合國力競爭的日趨激烈。
當然,很多科研人員仍然對這種開放式的科研持高度懷疑態度——尤其是在競爭激烈的生物醫學領域,這是因為,你是否具有其專利權、推廣權和使用權,都取決於你是否是第一個公佈此新發現。從這個角度來講,科學2.0看似是危險的:使用個人博客與社交網路,與嚴謹認真的工作相比,感覺就像公開邀請大家去破壞自己的線上實驗室記錄——更糟的是,自己最佳的想法或發現,將可能被競爭對手所竊取、所公佈。
然而,對於科學2.0的擁護者而言,這種懷疑與猜測的氛圍是形成合作的信號。“當您線上地、公開地完成您的工作時”,Hooker稱,“您很快就會發現,您再也不必與其他科學家相互競爭,而變成與他們相互合作。”
激動人心的勝利
從原則上說,公共科學圖書館(PLoS ONE)的Surridge認為,科學家們應當尋找到達Web 2.0的完全自然的過渡途徑。事實證明,自從伽利略(Galileo)與牛頓(Newton)的時代以來,科學家們已經通過“積累(crowd-source)”眾多研究者的貢獻來構建知識體系,並通過公開辯論來去偽存真。“Web 2.0與科學研究的方法保持完全一致,問題不在於其是否會轉變,而在於轉變得會有多快。”他認為。
麻省理工學院(MIT)的OpenWetWare項目堪稱一個早期的成功嘗試。該專案始於2005年春,由麻省理工學院生物工程專業的合成生物學研究生Drew Endy與Thomas Knight發起,最初被用於兩個實驗室的網站,使之保持即時更新。OpenWetWare是一個維琪(wiki)——即一個公開由用戶共同完成的協作網站,任何人可通過流覽器進入並對其進行編輯,它甚至與線上百科全書Wikipedia具有相同的用戶程式。學生們皆樂於在此自主地發佈他們的自我介紹與研究經歷,而不需要通過網管來幫助他們完成。
但到後來,學生用戶們則發現維琪也是一個發表自己習得實驗室技術的便利之地——熟練提取與分析DNA、培養細胞生長等等。“許多的‘怎麼做’就在實驗室中傳開來,成為實驗室規章手冊中沒有的必備知識”,一名研究生亦是OpenWetWare督導委員會成員Jason Kelly說。“我們以前也沒有實驗室手冊”,大多數學生來自同一個學科背景,亦即一個幾乎沒有導師的全新實驗室。因此不管是學生還是博士後,無論何時偶然觸犯了實驗室規則後,他就會在這個教訓被忘掉之前將它記錄在一個維琪頁面上。而當其他人無論想出什麼花招來對付之後,也會在頁面上給予補充。這並不是一種無私的表現,督導委員會的成員Reshma Shetty注意到,“這些資訊對自己而言其實很重要。”但通過幫助自己,她繼續說道,“這些資訊也對全世界的人起到了作用。”
事實上,Kelly指出,“大多數的訪客首次來到我們網站,是由於他們在Google上搜索過關於某條規則的進一步資訊,看到搜索結果正發佈在我們的網頁上,並驚訝地說‘嘿!’。隨著越來越多實驗室的進入,他們也越來越顯著地發現,他們還能在這個網站上做許多其他有趣的事。”
比如說,課程。學生們並不像教授那樣僅用一個靜態頁面來隨便湊合,他們嘗試創建具有動態流程的課程研究,他們能夠在此發佈實驗結果、提問、討論、解答,甚至合寫論文。“而且那些所有保存在網站上的,將對第二年的課程學習有所裨益”,Shetty這樣認為,並為創建這種課程網站製作了相應的OpenWetWare範本。
又如,實驗室管理。“我之前並不知道維琪是什麼東西”,負責俄勒岡保健科學大學(Oregon Health & Science University)一間遺傳性疾病(範可尼貧血症)實驗室的Maureen Hoatlin回憶說。不過,她也清楚地知道,她所研究領域發展的混亂,使得她難以與她團隊成員的研究保持同步,更不用說其他地方的範可尼貧血症的研究者了。“我一直在尋求一種工具,來幫助我組織這些所有的資訊,”Hoatlin說道。“一方面,我希望它是基於網路的,因為我經常出行,因此希望在任何地方都能流覽到它;另一方面,我希望我的合作者與團隊成員能夠自由地添加資訊,這樣能夠確保我在網頁上所看見的資訊是近期更新的版本。”
Hoatlin在2006年春發現了OpenWetWare,並認為其與自己的需求符合得極為吻合。“這種公開和透明,事實證明是非常有效的”,她說,“我愛上了這種交流互動,事實上其他實驗室的人也可以對我們的研究作出評論,反之亦然。我們見證著它以如此之快的速度、如此之強的力量推動科學的發展——沒有什麼能勝過它。”
眾多的其他研究工作也正通過OpenWetWare協作開展。該網站最活躍的營利團體之一,SyntheticBiology.org,目前擁有三個國家的六所實驗室,涉及工作、會議、道德討論以及其他的很多內容都會公佈於此。
總而言之,OpenWetWare已經迅速地發展成為一個社會網路,可以滿足不同層面的生物學家與生物工程師。目前隸屬於它的實驗室遍及全球五大洲,另有數十所的培訓班與營利團體、數以百計的討論議題——逾6100個網頁為3000名註冊用戶所編輯。在2007年5月,經美國國家科學基金會撥款授予,OpenWetWare團隊將實施一項為期五年的計畫,使之在當前麻省理工學院的基礎上,發展成為一個獨立自主的組織。資金也將用於支持各種新型實用工具的完善,譬如生物學資料庫與維琪的介面方式,以及OpenWetWare的通用版本,可用於其他領域(譬如神經系統)的研究與個人獨立研究。 (待續)
作者: M. Mitchell Waldrop
譯者: jiangyh
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